|
Insignia-o nouă metodă de identificare a virusurilor și a bacteriilor. |
|
|
|
23 Mai 2007 |
 Odată cu identificarea secvențelor genomice a
sute de bacterii și virusuri este posibilă proiectarea unor teste care pot
detecta rapid prezența acestor specii pe baza ADN-ului lor. Aceste teste pot
detecta prezența unui organism patogen dintr-o mixtură de material organic prin
recunoașterea unei secvențe scurte și distincte numite semnături ADN care apar
la un anumit
patogen și nu există la alte specii.
Adam Phillippy împreună cu colegii săi
de la Universitatea din Maryland, SUA, au dezvoltat un program computerizat
care poate identifica aceste semnături ADN cu o acuratețe mult mai mare decât
s-a reușit până în prezent. Ei au descris acest nou sistem, numit Insignia și
succesul rezultatelor obținute pe 46 de tulpini de Vibrio cholerae la Open
Access journal PLoS Computational Biology. Insignia utilizează un algoritm cu
eficiență înaltă pentru a compara genomul bacteriilor și virusurilor cunoscute
și pentru a arhiva genomul diferitelor organisme, inclusiv al plantelor,
animalelor și al oamenilor. Aceste comparații sunt memorate într-o bază de date
și sunt folosite pentru identificarea rapidă a semnăturilor genetice.
Programul creat poate avea o
multitudine de aplicații, de la diagnosticarea infecțiilor la oameni la
detectarea microbilor patogeni din sursele de apă.
Bacteriile și virusurile patogene au
reprezentat dintotdeauna una dintre cele mai mari amenințări pentru sănătatea
publică, amenințare care a crescut în ultima vreme datorită dezvoltării unor
agenți prin inginerie genetică. În domeniul secvențierii genomului în ultimul
deceniu a fost secvențiat complet genomul a sutelor de bacterii și a miilor de
virusuri, secvențieri care acum fac posibilă dezvoltarea unor programe ca
Insignia, programe capabile să detecteze un anumit virus sau o anumită
bacterie.
Acest articol a fost citit de 1169 ori.
|